更年期是女性生命發展的自然歷程，在這個階段，因為體內荷爾蒙減少，有些婦女會經驗一些不適的現象，如熱潮紅、盜汗、心悸、失眠……等，荷爾蒙常被使用於治療更年期的不適現象，及預防停經婦女骨質流失。

所謂荷爾蒙療法，就是補充自然停經或兩側卵巢切除後所缺乏的女性荷爾蒙；目前臨床上大致可分成三種方法：

只含有雌激素的荷爾蒙療法：
因為雌激素易刺激子宮內膜增生，進而增加子宮內膜癌的風險，因此，只適用於子宮已經切除的婦女。
週期性順序型的荷爾蒙療法：
此類型的荷爾蒙療法，含有雌激素以及黃體素，所以，除了每一週期每天皆服用雌激素之外，須依序在週期後段再添加12－14天的黃體素，此類療法多數會產生每個月類似月經來潮的出血。
連續性合併型的荷爾蒙療法：
雌激素合併黃體素每天連續使用，此類型的荷爾蒙療法，由於每天使用雌激素與黃體素，因此，不會刺激子宮內膜增生，不會增加子宮內膜癌的風險。使用此種療法能夠避免每月類似月經來潮的出血現象，但臨床上仍有少部分婦女會產生不規則出血。

台灣更年期醫學會就荷爾蒙治療指引於2004年提出說明如下：

荷爾蒙治療仍是緩解婦女更年期症狀最有效的方法。如僅為治療局部性症狀，如陰道萎縮、性交困難、萎縮性陰道炎，建議使用局部性雌激素療法。
在使用荷爾蒙治療之前及長期使用荷爾蒙時，所有的婦女都應接受完整的健康及風險評估。
雌激素和黃體素治療超過五年以上，發生乳癌危險性便會少許升高。建議定期作乳房檢查(超音波、乳房攝影)。
根據WHI研究報告顯示，子宮切除之停經婦女使用雌激素，會增加中風之危險，減少股骨骨折之危險。但使用雌激素6.8年以內乳癌的發生率減少，同時不會影響冠心病發生率。
建議不要為了預防心血管疾病而處方荷爾蒙療法，對停經並保有子宮的婦女，可以使用其他藥物或方法降低心血管疾病。
醫師應提供專業諮詢，告知婦女荷爾蒙療法的好處與可能帶來的風險，已決定是否需使用。
黃體素在主要更年期相關適應症中的用途為保護子宮內膜不受未經拮抗之雌激素影響，對所有正在使用雌激素療法且子宮完整的婦女，建議醫師處方適當的黃體素，對無子宮的婦女則不應處方黃體素。但黃體素似乎有明顯處進乳癌及冠心病之不良作用。
在降低停經後發生骨質疏鬆性骨折的危險性方面及降低大腸癌的危險性方面，荷爾蒙治療的療效已經獲得明確的證實。停經婦女應做一次DXA(Spine AP View)之骨密度測定，若確定為骨質疏鬆症，則建議使用荷爾蒙治療五年以上。
荷爾蒙治療在停經初期(3年以內)就開始使用，則其效益高且風險低。使用時應考慮劑量較標準量為低的荷爾蒙療法。
針劑荷爾蒙療法，因其長期使用之療效及危險性仍未確定，不建議使用。

雖然更年期使用荷爾蒙會有一些立即可見的效果及可預期效益，但長期使用也有一些健康上的考量，因此，荷爾蒙療法需依個人需求並與醫師商討是否適用及如何使用等，以決定最好的選擇。